Related Posts Plugin for WordPress, Blogger...
 
Jumat, 09 Desember 2011

Membuat File Input GAMESS US

1 komentar
GAMESS U.S.
Untuk melakukan perhitungan dengan perangkat lunak GAMESS U.S. kita memerlukan suatu file input yang berisi informasi mengenai sistem perhitungan yang akan kita lakukan. Informasi yang diperlukan meliputi parameter perhitungan, parameter sistem, parameter kontrol, serta koordinat file. Semua parameter tersebut dirangkum dalam satu file input yang memiliki ekstensi .inp . Untuk menjalankan file input pada sistem linux, kita  dapat menggunakan perintah:
rungms nama_file.inp > nama_file.out

Deskripsi File Input
  • Strukrur file input secara umum dibagi ke dalam beberapa parameter atau sering disebut dengan kartu.
  • Setiap parameter diawali dengan kode parameter ($KODE, diawali dengan '$') serta diakhiri dengan batas akhir paramter ($END, diawali dengan '$').
  • Di dalam kode parameter (diantara $KODE dan $END) kita dapat menyebutkan besaran-besaran dalam paramter sesuai dengan yang kita inginkan.
  • Besaran-besaran tersebut spesifik untuk setiap parameter.
  • Penulisan setiap kode parameter harus memiliki jarak satu spasi dari batas paling kiri dokumen.
  • Contoh untuk penulisan parameter kontrol, kode parameter kontrol adalah $CONTRL:

    <satu spasi>$CONTRL SCFTYP=UHF RUNTYP=ENERGY ICHARG=0 MULT=1 $END
                        $SYSTEM ............................................................................................... $END
                        $DATA .................................................................................................... $END
Deskripsi Parameter
$CONTRL: Mengontrol data-data kimia.

  • SCFTYP
    = RHF   Perhitungan Restricted Hartree-Fock (default).
    = UHF  Perhitungan Unrestricted Hartree-Fock
    = ROHF  Perhitungan Restricted open shell Hartree-Fock
  • RUNTYP
    = ENERGY  Energi Molekul (default)
    = GRADIENT  Perhitungan energi molekul dilanjutkan dengan gradien
    = HESSIAN  Perhitungan energi dilanjutkan dengan gradien, dilanjutkan dengan turunan kedua, termasuk analisis tetapan vibrasi.
    = OPTIMIZE  Optimasi geometri molekul menggunakan gradien energi .
    = SADPOINT  Menentukan saddle point, atau keadaan transisi
  • MAXIT
    = <angka>  Jumlah siklus iterasi maksimal untuk perhitungan SCF. (default=30)
  • ICHARG
    = <angka>  Muatan total molekul. (default=0, netral)
  • MULT
    = <angka>  Multiplisitas keadaan elektronik
    = 1               Singlet(default)
    = 2, 3           Doublet, triplet
  • COORD
    = CART     Koordinat yang digunakan pada $DATA adalah kartesian.
    = ZMT       Koordinat yang digunakan adalah z-matrix

$SYSTEM: Kontrol untuk sistem komputer secara global.

  • TIMLIM
    = <angka, dalam menit>   Pengaturan waktu maksimum running gamess.
  • MWORDS
    = <angka, dalam MWORDS> Pengaturan maksimum memori yang digunakan dalam perhitungan.
$DATA
Parameter ini menjelaskan data molekul secara global, seperti koordinat inti atom dan simetri. Koordinat inti atom dapat dicantumkan menggunakan format kartesian maupun z-matrix. Struktur dari parameter ini adalah:
TITLE  --> Deskripsi singkat data koordinat
GROUP --> Data kelompok simetri yang digunakan, jika tidak ingin menggunakannya, maka dapat dituliskan C1.
KOORDINAT

Contoh file input gamess sederhana dapat dilihat sebagai berikut.

 $CONTRL SCFTYP=RHF RUNTYP=OPTIMIZE COORD=ZMT NZVAR=0 $END
 $SYSTEM TIMLIM=1 $END
 $STATPT OPTTOL=1.0E-5  $END
 $BASIS  GBASIS=STO NGAUSS=2 $END
 $GUESS  GUESS=HUCKEL $END
 $DATA
Methylene...1-A-1 state...RHF/STO-2G
Cnv  2

C
H  1 rCH
H  1 rCH  2 aHCH

rCH=1.09
aHCH=110.0
 $END

Contoh tersebut adalah untuk optimasi geometri molekul metilena menggunakan basis set STO-2G.
Untuk lebih banyak contoh file input dan penjelasannya, dapat dilihat di halaman berikut:
http://www.msg.ameslab.gov/tutorials/tutorials.html


One Response so far.

  1. kita juga punya nih artikel mengenai optimasi geometri, silahkan dikunjungi dan dibaca , berikut linknya
    http://repository.gunadarma.ac.id/bitstream/123456789/3272/1/Kommit2004_kecerdasan_009.pdf
    semoga bermanfaat

Leave a Reply

 
Majalah Kimia © 2011 DheTemplate.com & Main Blogger. Supported by Makeityourring Diamond Engagement Rings

You can add link or short description here